ОБНБиоорганическая химия Russian Journal of Bioorganic Chemistry

  • ISSN (Print) 0132-3423
  • ISSN (Online) 1998-2860

ТРАНСКРИПТОМНЫЙ АНАЛИЗ ВЛИЯНИЯ УРОВНЯ ЦИТОСКЕЛЕТНОГО БЕЛКА ЗИКСИНА НА ПРОЦЕССЫ МЕТАБОЛИЗМА И СИГНАЛЬНЫЕ ПУТИ НА МОДЕЛИ ЭМБРИОНОВ ШПОРЦЕВОЙ ЛЯГУШКИ

Код статьи
S19982860S0132342325050124-1
DOI
10.7868/S1998286025050124
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 51 / Номер выпуска 5
Страницы
873-881
Аннотация
Зиксин – белок цитоскелета, регулирующий сборку и восстановление активовых филаментов. Исследования, проведенные в нашей лаборатории на модели эмбрионов шпорцевой лягушки , показали, что зиксин играет важную роль в регуляции экспрессии генов и клеточной дифференцировке. В работах последних лет мы получили интересные данные, указывающие на способность этого механочувствительного белка участвовать в механизмах, связывающих морфогенетические движения с экспрессией генов, ответственных за формирование осевых структур и стволового статуса клеток в самом сложном процессе в жизни любого организма – эмбриогенезе. В этой статье мы представляем последние полученные результаты по поиску генов, сигнальных путей и биологических процессов, которые регулируются с участием зиксина. Для исследования было использовано высокопроизводительное секвенирование пулов мРНК из клеток эмбрионов на стадии нейрулы с нормальной, повышенной и подавленной при помощи морфолиновых олигонуклеотидов функцией зиксина. Использование биоинформатического анализа позволило выделить из большого числа генов зиксин-зависимые сигнальные пути и биологические процессы, важные для эмбриогенеза. Показано, что подавление зиксина приводит к изменению в экспрессии генов-участников более 16 сигнальных каскадов и влияет на 27 биологических процессов, из которых наиболее выраженные связаны с морфогенезом и генной экспрессией. Результаты работы имеют прежде всего фундаментальное значение. Изучение роли зиксина в передаче сигналов от механических стимулов к аппарату генной экспрессии важно для изучения координации биомеханики и дифференцировки в ходе эмбриогенеза, а в перспективе предоставляет возможность использования зиксина в качестве потенциального диагностического маркера для ряда заболеваний.
Ключевые слова
сигнальные пути секвенирование генная онтология биологические процессы зиксин
Дата публикации
01.05.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
1

Библиография

  1. 1. Martynova N.Y., Eroshkin F.M., Ermolina L.V., Ermakova G.V., Korotaeva A.L., Smurova K.M., Gyoeva F.K., Zaraisky A.G. // Dev. Dyn. 2008. V. 237. P. 736–749. https://doi.org/10.1002/dvdy.21471
  2. 2. Martynova N.Y., Ermolina L.V., Eroshkin F.M., Gioeva F.K., Zaraisky A.G. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2008. V. 34. P. 513–516. https://doi.org/10.1134/S1068162008040183
  3. 3. Martynova N.Y., Ermolina L.V., Ermakova G.V., Eroshkin F.M., Gyoeva F.K., Baturina N.S., Zaraisky A.G. // Dev. Biol. 2013. V. 380. P. 37–48. https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2013.05.005
  4. 4. Martynova N.Y., Ermolina L.V., Eroshkin F.M., Zaraisky A.G. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2015. V. 41. P. 1–5. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27125030
  5. 5. Martynova N.Y., Parshina E.A., Eroshkin F.M., Zaraisky A.G. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2020. V. 46. P. 530–536. https://doi.org/10.31857/S013234232004020X
  6. 6. Parshina E.A., Eroshkin F.M., Orlov E.E., Gyoeva F.K., Shokhina A.G., Staroverov D.B., Belousov V.V., Zhigalova N.A., Prokhortchouk E.B., Zaraisky A.G., Martynova N.Y. // Cell Rep. 2020. V. 33. P. 108396. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2020.108396
  7. 7. Parshina E.A., Orlov E.E., Zaraisky A.G., Martynova N.Y. // Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 5627. https://doi.org/10.3390/ijms23105627
  8. 8. Martynova N.Y., Parshina E.A., Zaraisky A.G. // FEBS J. 2021. V. 290. P. 66–72. https://doi.org/10.1111/febs.16308
  9. 9. Parshina E.A., Zaraisky A.G., Martynova N.Y. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2024. V. 50. P. 338–344. https://doi.org/10.31857/S0132342324030133
  10. 10. Huang D.W., Sherman B.T., Lempicki R.A. // Nat. Protoc. 2009. V. 4. P. 44–57. https://doi.org/10.1038/nprot.2008.211
  11. 11. Hirota T., Morisaki T., Nishiyama Y., Marumoto T., Tada K., Hara T., Masuko N., Inagaki M., Hatakeyama K., Saya H. // J. Cell Biol. 2000. V. 149. P. 1073–1086. https://doi.org/10.1083/jcb.149.5.1073
  12. 12. Zhou J., Zeng Y., Cui L., Chen X., Stauffer S., Wang Z., Yu F., Lele S.M., Talmon G.A., Black A.R., Chen Y., Dong J. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2018. V. 115. P. E6760–E6769. https://doi.org/10.1073/pnas.1800621115
  13. 13. Brunet A., Bonni A., Zigmond M.J., Lin M.Z., Juo P., Hu L.S., Anderson M.J., Arden K.C., Blenis J., Greenberg M.E. // Cell. 1999. V. 96. P. 857–868. https://doi.org/10.1016/s0092-8674 (00)80595-4
  14. 14. Dijkers P.F., Medema R.H., Lammers J.W., Koenderman L., Coffer P.J. // Curr. Biol. 2000. V. 10. P. 1201– 1204. https://doi.org/10.1016/s0960-9822 (00)00728-4
  15. 15. Lee S.S., Kennedy S., Tolonen A.C., Ruvkun G. // Science. 2003. V. 300. P. 644–647. https://doi.org/10.1126/science.1083614
  16. 16. Lee J.W., Hur J., Kwon Y.W., Chae C.W., Choi J.I., Hwang I., Yun J.Y., Kang J.A., Choi Y.E., Kim Y.H., Lee S.E., Lee C., Jo D.H., Seok H., Cho B.S., Baek S.H., Kim H.S. // J. Hematol. Oncol. 2021. V. 14. P. 148. https://doi.org/10.1186/s13045-021-01147-6
  17. 17. Liang X., Ding Y., Zhang Y., Chai Y.H., He J., Chiu S.M., Gao F., Tse H.F., Lian Q. // Cell Death Dis. 2015. V. 6. P. e1765. https://doi.org/10.1038/cddis.2015.91
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека