- Код статьи
- S19982860S0132342325030165-1
- DOI
- 10.7868/S1998286025030165
- Тип публикации
- Статья
- Статус публикации
- Опубликовано
- Авторы
- Том/ Выпуск
- Том 51 / Номер выпуска 3
- Страницы
- 538-544
- Аннотация
- Исследована эффективность маркирования GC-богатой области промотора гена TERT в геноме человека производными 5'-трифосфатов 2'-дезоксиуридина (dU) и 2'-дезоксицитидина (dC), содержащими цианиновые красители Cy5 и Cy7 в качестве флуоресцентной метки. Методом ПЦР в реальном времени оценивали влияние модифицированных нуклеотидов на эффективность ПЦР, также определяли степень включения нуклеотидов в ПЦР-продукт. Эффективность маркирования ДНК-матрицы определяли по интенсивности флуоресцентного сигнала при проведении аллель-специфичной гибридизации на биологическом микрочипе. Наибольший уровень флуоресценции ячеек биочипа наблюдали для производных dU-Cy7 по сравнению с производными dU- и dC-Cy5. В то же время в случае GC-богатой ДНК-матрицы использование производных dC-Cy5 давало принципиально лучший результат по сравнению с производным dU-Cy5. Таким образом, модифицированные аналоги Cy7, способные встраиваться в ДНК при проведении ПЦР, в меньшей степени зависят от GC-состава ДНК-матрицы и выступают более универсальными флуоресцентными метками для диагностических целей. Наиболее перспективным представляется дальнейшее применение модифицированных аналогов Cy7 при разработке тест-систем формата “лаборатория-на-чипе”.
- Ключевые слова
- промотор гена TERT GC-богатая область мутация флуоресценция цианиновые красители модифицированные нуклеотиды биологический микрочип
- Дата публикации
- 07.12.2025
- Год выхода
- 2025
- Всего подписок
- 0
- Всего просмотров
- 3
Библиография
- 1. Stumpf A., Brandstetter T., Hübner J., Rühe J. // PLoS One. 2019. V. 14. P. e0225525. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0225525
- 2. Dullaert-de Boer M., Akkerman O.W., Vermeer M., Hess D.L.J., Kerstjens H.A.M., Anthony R.M., van der Werf T.S., van Soolingen D., van der Zanden A.G.M. // PLoS One. 2018. V. 13. P. e0190847. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0190847
- 3. Ikonnikova A.Y., Filippova M.A., Surzhikov S.A., Pozhitnova V.O., Kazakov R.E., Lisitsa T.S., Belkov S.A., Nasedkina T.V. // Drug Metab. Pers. Ther. 2020. V. 36. P. 33-40. https://doi.org/10.1515/dmpt-2020-0155
- 4. Leevy W.M., Gammon S.T., Johnson J.R., Lampkins A.J., Jiang H., Marquez M., Piwnica-Worms D., Suckow M.A., Smith B.D. // Bioconj. Chem. 2008. V. 19. P. 686-692. https://doi.org/10.1021/bc700376v
- 5. Шершов В.Е., Иконникова А.Ю., Василисков В.А., Лапа С.А., Мифтахов Р.А., Кузнецова В.Е., Чудинов А.В., Наседкина Т.В. // Биофизика. 2020. Т. 65. С. 865-871. https://doi.org/10.31857/S0006302920050038
- 6. Фесенко Д.О., Гусейнов Т.О., Лапа С.А., Кузнецова В.Е., Шершов В.Е., Спицын М.А., Наседкина Т.В., Заседателев А.С., Чудинов А.В. // Мол. биология. 2018. Т. 52. С. 533-542. https://doi.org/10.7868/S0026898418030175
- 7. Иконникова А.Ю., Шершов В.Е., Мороз Ю.В., Василисков В.А., Лапа С.А., Мифтахов Р.А., Кузнецова В.Е., Чудинов А.В., Наседкина Т.В. // Биофизика. 2021. Т. 66. С. 31-39. https://doi.org/10.31857/S000630292101004X
- 8. Bell R.J., Rube H.T., Xavier-Magalhães A., Costa B.M., Mancini A., Song J.S., Costello J.F. // Mol. Cancer Res. 2016. V. 14. P. 315-323. https://doi.org/10.1158/1541-7786.MCR-16-0003
- 9. Фесенко Д.О., Абрамов И.С., Шершов В.Е., Кузнецова В.Е., Суржиков С.А., Гречишникова И.В., Барский В.Е., Чудинов А.В., Наседкина Т.В. // Мол. биология. 2018. Т. 52. С. 997-1005. https://doi.org/10.1134/S0026898418060071
- 10. Lapa S.A., Volkova O.S., Spitsyn M.A., Shershov V.E., Kuznetsova V.E., Guseinov T.O., Zasedatelev A.S., Chudinov A.V. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2019. V. 45. P. 263-272. https://doi.org/10.1134/S1068162019040046
- 11. Иконникова А.Ю., Лисица Т.С., Шершов В.Е., Спицын М.А., Гусейнов Т.О., Фесенко Д.О., Лапа С.А., Кузнецова В.Е., Заседателев А.С., Чудинов А.В., Наседкина Т.В. // Биофизика. 2017. Т. 62. С. 1093- 1098.
- 12. Boyer A.E., Lipowska M., Zen J.-M., Patonay G. // Anal. Lett. 1992. V. 25. P. 415-428. https://doi.org/10.1080/00032719208016105
- 13. Varachev V.O., Guskov D.A., Shekhtman A.P., Rogozhin D.V., Polyakov S.A., Zacedatelev A.S., Chudinov A.V., Nasedkina T.V. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2023. V. 49. P. 1137-1142. https://doi.org/10.1134/S1068162023050205
- 14. Varachev V., Shekhtman A., Guskov D., Rogozhin D., Zasedatelev A., Nasedkina T. // Diagnostics (Basel). 2024. V. 14. P. 200. https://doi.org/10.3390/diagnostics14020200
