By this author

Searching for Possible Sites of Electrophils Conjugation with Biomolecules Using Molecular Modeling Methods

Issue number 3 from 07.12.2025

Способность к быстрой реакции образования аддуктов с нуклеофильными группами белков, нуклеиновых кислот и липидов во многом определяет токсические эффекты электрофилов. С учетом того, что количество токсичных электрофилов практически не ограничено, а образовывать аддукты они могут со многими молекулярными мишенями, сугубо эмпирический подход к характеристике аддуктома заведомо непродуктивен. Цель настоящего исследования - разработать методику первичной in silico оценки вероятности конъюгации электрофилов с тем или иным сайтом модификации. Для модельной группы электрофилов с помощью метода теории функционала плотности были рассчитаны квантово-химические индексы, методом молекулярного докинга проведен поиск приоритетных сайтов ковалентного связывания исследуемых веществ. На основании полученных результатов была разработана шкала для оценки жесткости электрофилов и составлен алгоритм для компьютерного отбора возможных сайтов конъюгации электрофилов с биологическими макромолекулами.

4 0